厭氧處理系統適用範圍：

較適合用於高COD濃度，且由有機物組成穩定的廢水，如食品、畜產相關行業。此類厭氧廢水系統運轉成本高，但能帶來的效益及運轉成功機率也高。

厭氧生物處理系統有幾大優點：

1. 佔地面積小，單位空間內系統可承受的有機負荷為好氧活性污泥數倍
2. 耗電量小，處理相同COD需耗費的電力僅為好氧生物處理的10%以下
3. 污泥產生量少，處理相同COD所產生的污泥僅為好氧生物處理的20%以下
4. 可分解部分難分解的有機物，好氧環境下部分難分解的有機物，在厭氧狀態下可得到很好的處理效果

厭氧生物處理系統的潛在風險：

1. 啟動過程較慢，從工程完成到順利運轉，往往需耗時數月，且若受異常pH或其他環境因素影響（如異常高溫、大量油脂、抑制性化學物質），從異常狀態中恢復的速度較慢
2. COD去除率有限，受質傳及代謝產物比例影響，厭氧生物處理系統的COD去除率落在50%~90%，單做厭氧處理系統較無法輕易達到放流標準，且厭氧槽出流水往往帶有異味，因此後端需要再加一組好氧生物處理系統將COD做更進一步的臭味去除
3. 菌群活性受溫度影響較大，因此厭氧生物處理系統在冬天跟夏天處理效率會不太一樣，但越大的反應槽受外界氣溫的影響就會越小
4. 較易產生臭味，廢水含硫酸鹽濃度越高時越容易發生，對排氣裝設洗滌塔即可解決
5. 工程門檻較高，厭氧處理系統的工程難度大於好氧處理系統，且完工運轉後要對槽體內部進行修改調整的難度及成本亦高